1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران 2- مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان و گروه ایمنیشناسی و میکروبشناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران ، arjomandzadegan@arakmu.ac.irn 3- مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران 4- مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک،ایران 5- دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران
چکیده: (5781 مشاهده)
زمینه: سرعت رشد سلولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس وابسته به رونویسی rRNA است که در مایکوباکتریوم توسط ژن carD کنترل می-شود. هدف این تحقیق، ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع سویههای کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی متفاوت است. مواد و روشها: ژنوم تخلیص شده 38 سویه بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت دارویی مختلف انتخاب شدند. پرایمرهای مورد نظر، با تعیین ژنهای بالادست و پایین دست جهت تکثیر کامل ژن carD طراحی و با نرمافزارهای مربوطه ارزیابی شدند. با محاسبه دمای ذوب، دمای اتصال و برنامه PCR تنظیم شد. وجود ژن تکثیر شده با کمک الکتروفورز تأیید گردید. ژن، خالصسازی شده و مورد سکانس (توالی یابی) قرار گرفت. یافتهها: بررسی نتایج تعیین توالی نشان داد که ژن carD در نمونههای مختلف کلینیکی و سویه استاندارد، یکسان بوده و الگوی مشابهای دارد. در این تحقیق مشخص گردید که دامین TRCF درمنطقه N ترمینال پروتئین carD در سویههای مورد مطالعه کاملاً حفاظت شده است. نتیجهگیری: این تحقیق، اولین مطالعه روی ژن card در سویههای بالینی میباشد. نتیجه سکانس، تعیین کننده وجود حفاظت در این ژن بود. با توجه به اهمیت این ژن در زندگی باکتری و عدم تغییر در توالی آن، در مطالعات آینده این ژن بهعنوان هدفی مناسب برای تشخیص سریع و نیز طراحی یک مهار کننده ضد میکوباکتریوم پیشنهاد میگردد.
Pirayandeh M, Nazari R, Zolfaghari M R, Arjmandzadegan M, Ahmadi A, shojapoor M et al . Evaluation of conservation in carD sequence’s gene and its application in rapid detection of Mycobacterium tuberculosis. Iran South Med J. 2014; 17 (3) :263-271 URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-538-fa.html
پیراینده مینا، نظری راضیه، ذوالفقاری محمدرضا، ارجمندزادگان محمد، احمدی اعظم، شجاعپور مانا و همکاران.. ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع مایکوباکتریوم توبرکلوزیس. طب جنوب. 1393; 17 (3) :271-263
Iranian South Medical Journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License which allows users to read,
copy, distribute and make derivative works for non-commercial purposes from the material, as long as the author of the original work is cited properly