آزمایش میکروسکوپی مدفوع نمی تواند انتامبا هیستولیتیکا را از انتامبا دیسپار تفریق دهد.جهت تشخیص و تفریق این دو گونه از یکدیگر،ایزوآنزیم الکتروفورزیس یک روش استاندارد طلایی می باشد. برای شناسائی زایمودم های مختلف انتامبا هیستولیتیکا / دیسپار در جنوب کشور ، 23 نمونه مثبت شناسائی شدند و با استفاده از الکتروفورز، ایزوآنزیم های چهار آنزیم هگزوکیناز،مالیک انزیم،فسفوگلوکوموتاز و گلوکز فسفات ایزومراز آنها مورد بررسی قرار گرفت.از این تعداد 6 مورد انتامبا هیستولیتیکا و بقیه 17 مورد انتامبا دیسپار تشخیص داده شدند.زایمودم نمونه های انتامبا هیستولیتیکا II و XIV و زایمودم نمونه های انتامبا دیسپار I، XVI،XVII و XVIII تشخیص داده شدند. در نتیجه بر اساس روش شناسایی آیززوآنزیم الکتروفورزیس ، بسیاری از نمونه هایی که بعنوان انتامبا هیستولیتیکا گزارش شده اند در حقیقت آنتامبا دیسپار می باشند .