fa مقایسه مدل ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیجینگ با سایر سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش MIRU-VNTR عمومى General پژوهشي Original <div style="text-align: right">زمینه: اخیراًٌ نشان داده شده است که سوش‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ، رابطه مستقیمی با مقاومت دارویی دارند. بنابراین روشی ساده و سریع برای تشخیص و تمایز ایزوله‌های خانواده بیجینگ مورد نیاز می‌باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی قدرت تمایز لوکوس‌های مختلف دو روش 15 MIRU-VNTR و 12 MIRU-VNTR برای سویه-های بیجینگ و مقایسه آن با سایر سویه&lrm;های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می‌باشد. مواد و روش‌ها ابتدا 105 سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روش‌های اسپولیگوتایپینگ شناسایی شدند، سپس با روش‌های 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR مورد آنالیز ژنومی قرار گرفتند و تنوع آللی هر یک از لوکوس‌ها با استفاده از آزمون HunterGaston Discriminatory Index (HGI) محاسبه شد. یافته‌ها: از 105 سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روش اسپولیگوتایپینگ، 20 سویه بیجینگ شناسایی شد (05/19 درصد). بررسی با روش 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR در کل سویه‌ها نشان داد که 11 لوکوس جزء لوکوس‌های بسیار افتراق‌دهنده بودند (6/0HGI&ge;) که از بین آن‌ها لوکوس QUB26 بالاترین قدرت تمایز را داشت (84/0=HGI). تعداد تکرارها در لوکوسQUB11b برای سویه‌های بیجینگ اختصاصی بود. تنها لوکوس بسیار افتراق‌دهنده برای سویه‌های بیجینگ، MIRU16 بود. لوکوس‌های QUB26، Mtub21،MIRU39 ، MIRU27، MIRU23 و MIRU26 جز لوکوس‌های افتراق-دهنده متوسط (4/0&ge;<hgi6>HGI). نتیجه‌گیری: روش 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR ساده و سریع هستند و برای تمایز سویه‌های بیجینگ از سایر سویه-های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مناسب می‌باشند، اما برای تمایز بین سویه‌های مختلف بیجینگ مناسب نمی‌باشند و الگوهای به‌دست آمده تقریباٌ مشابهند. قدرت افتراق روش 15 لوکوسی برای تمایز سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بالاتر از روش 12 لوکوسی بود. </hgi6></div> <p>Background: Recently it is shown that Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype are associated with drug resistance. Thus a simple and rapid method is required for identification and differentiation of Beijing family isolates. Therefore the aim of this study is to evaluate discriminatory power of different loci in both 12 MIRU-VNTR and 15 MIRU-VNTR Methods for Beijing genotype. Methods: In total 105 Mycobacterium tuberculosis strains were identified by spoligotyping, then genomic analysis was carried out by using 12 and 15 MIRU-VNTR methods. Allelic diversity for each locus was calculated using Hunter Gaston Discriminatory Index (HGI). Results: With spoligotyping 20 out of 105 isolates (19.05%) belonged to the Beijing family. Investigating all strains with 12 and 15 MIRU-VNTR showed that 11 loci were highly discriminative (HGI&ge;0.6) and QUB26 had the highest discriminatory power (HGI=0.84). Number of repeats in QUB11b was specific for Beijing genotype, and only MIRU16 was highly discriminator for this genotype. QUB26, Mtub21, MIRU39, MIRU27, MIRU23 and MIRU26 were moderately discriminator (0.4&le;HGI<0.6) and other loci were poorly discriminator for Beijing strains (HGI<0.4). Conclusion: 12 and 15 locus MIRU-VNTR are simple and rapid methods and suitable for differentiation of Beijing genotype from other MTB strains, however these two methods are not suitable for discriminating Beijing family among themselves. In overall discriminatory power of 15 locus MIRU-VNTR method was higher than 12 locus MIRU-VNTR.</p> MIRU-VNTR, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, ژنوتایپ بیجینگ, سل MIRU-VNTR, mycobacterium tuberculosis, Beijing genotype, tuberculosis 1 12 http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-247&slc_lang=fa&sid=1 Mohaddese Mozafari محدثه مظفری mohadeseh.mozafari@yahoo.com 570031947532846006545 570031947532846006545 Yes Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Parisa Farnia پریسا فرنیا 570031947532846006546 570031947532846006546 No Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Mehdi Jafarian مهدی جعفریان 570031947532846006547 570031947532846006547 No Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Mohammadreza Razavi Deligani محمدرضا رضوی دلیگانی 570031947532846006548 570031947532846006548 No Islamic Azad University of Qom, Tehran, IRAN دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم Mehdi Kazempour مهدی کاظم پور 570031947532846006549 570031947532846006549 No Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Mohammadreza Masjedi محمدرضا مسجدی 570031947532846006550 570031947532846006550 No Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Ali Akbar Velayati علی اکبر ولایتی 570031947532846006551 570031947532846006551 No Mycobacteriology research center (MRC), Shahid Beheshty University of Medical Sciences,‌Tehran, IRAN مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی