<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian South Medical Journal</title>
<title_fa>مجله طب جنوب</title_fa>
<short_title>Iran South Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>57</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal57</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-4374</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-6954</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/ismj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1391</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2012</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی کارآمدی روش‌های دیسک دیفیوژن، آگاراسکرین و E-test در مقایسه با Real-time PCR برای تشخیص استافیلوکوک‌های کواگولاز منفی مقاوم به متی‎سیلین جدا شده از نمونه‌های کلینیکی بیمارستان‌های آموزشی شهرکرد 1387</title_fa>
	<title>Comparison of the performance of Disk diffusion, Agar screening and E-test methods with Real-time PCR for the detection of methicillin resistant coagulase negative Staphylococcus strains isolated from clinical samples of Shahrekord university hospitals, 2008</title>
	<subject_fa>عمومى</subject_fa>
	<subject>General</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: right&quot;&gt;زمینه: استافیلوکوک&#8204;های کواگولاز منفی (CoNS) یکی از عوامل عفونت&#8204;های بیمارستانی هستند. هدف از این مطالعه مقایسه کارآمدی روش&amp;lrm;های دیسک دیفیوژن، آگار اسکرین و E-test در مقایسه با وجود ژنmecA است که به&#8204;روش Real-time PCR در ایزوله&amp;lrm;های کلینیکی استافیلوکوک کواگولاز منفی مقاومت به متی&#8204;سیلین، به&#8204;عنوان استاندارد طلایی تعیین شد. مواد و روش&#8204;ها: 88 ایزوله استافیلوکوک کواگولاز منفی از نمونه&#8204;های بالینی بیمارستان&#8204;های آموزشی شهرکرد جدا شدند. با روش&amp;lrm;های دیسک دیفیوژن، آگار اسکرین، E-test سویه&#8204;های مقاوم به متی&#8204;سیلین شناسایی شده و وجود ژن mecA به-روش Real-time PCR تعیین گردید. مقایسه نتایج روش&#8204;های انجام شده با نتایج Real-time PCR توسط آزمون کای مربع و آزمون دقیق فیشر انجام گردید. یافته&#8204;ها: از بین 88 ایزوله استافیلوکوک کواگولاز منفی، 46 مورد (3/52 درصد) حامل ژن mecA بودند و 42 مورد (7/47 درصد) فاقد این ژن بودند. نتایج همه روش&#8204;های استفاده شده ارتباط معنی&#8204;داری با Real-time PCR نشان دادند. E-test دارای حساسیت، اختصاصیت 100 درصد، اگزاسیلین آگار اسکرین (6/0 میکروگرم بر میلی&#8204;لیتر) به&#8204;ترتیب حساسیت و اختصاصیت 96 درصد و 98 درصد، حساسیت و اختصاصیت دیسک دیفیوژن به&#8204;ترتیب 91 درصد و 90 درصد بود. نتیجه&#8204;گیری: بر طبق مطالعه حاضر، بهترین روش فنوتیپی E-test می&#8204;باشد که استفاده از آن توصیه می&#8204;گردد. در صورت وجود محدودیت&#8204;های اقتصادی، روش آگاراسکرین (6/0 میکروگرم بر میلی&#8204;لیتر) که در تشخیص مقاومت به متی&#8204;سیلین در سویه&#8204;های استافیلوکوک گوآگولاز منفی از نظر صحت و مقرون به&#8204;صرفه بودن روش مناسبی می&#8204;باشد، نیز قابل پیشنهاد است.&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;Background: Coagulase Negative staphylococci (CoNS) are nosocomial pathogens. The main objective of the study was to compare the performance of disk diffusion, E-test and agar screening methods with Real-time PCR technique for detection of methicillin resistance in coagulase negative staphylococci (MRCoNS), using Taqman&amp;reg; Real-time PCR for mecA as the &amp;ldquo;gold standard&amp;rdquo; comparison assay. Methods: 88 coagulase negative Staphylococcus isolates were identified out of 284 Staphylococcus isolates collected from Hajar and Kashani hospitals-shahrekod, Iran. Methicillin resistance strains were identified by several methods: Disk diffusion, Agar screening, E-test and Real-time PCR. The results of the tested methods were compared with those of the Real-time PCR by Chi square or Fisher&amp;rsquo;s exact tests. Results: Of the 88 coagulase negative Staphylococcus isolates tested, 46 isolates (52.3%) were mecA-positive and 42 isolates (47.7%) were mecA-negative. The results of all the tested methods had a statistically significant agreement with those of Real-time PCR. The E-test was 100% sensitive and specific for mecA presence. The sensitivity and specificity of oxacillin agar screen (6.0 &amp;mu;g/ml) method were 96% and 98%, respectively and the sensitivity and specificity of oxacillin Disk diffusion method were 91% and 90%, respectively. Conclusion: In the present study, E-test is proposed as the best phenotypic method. In case economic issue matters, the oxacillin agar screening method (6.0 &amp;mu;g/ml), which is suitable for the detection of MRCoNS due to its accuracy and low cost, is recommended.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>استافیلوکوک کواگولاز منفی مقاوم به متی‌سیلین, دیسک دیفیوژن, آگاراسکرین, E-test, ژن mecA, real-time PCR</keyword_fa>
	<keyword>methicillin resistant coagulase negative staphylococcus, disk diffusion, agar screen, E-test, mecA gene, real- time PCR </keyword>
	<start_page>93</start_page>
	<end_page>100</end_page>
	<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-257&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Laleh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shariati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>لاله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شریعتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006514</code>
	<orcid>570031947532846006514</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Advanced Medical Technologies, Tehran University of Medical Sciences, ‌Tehran, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده فناوری‌های نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Majid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Validi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مجید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ولیدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006515</code>
	<orcid>570031947532846006515</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Medicine, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mana</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shojapour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مانا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شجاع پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006516</code>
	<orcid>570031947532846006516</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Advanced Medical Technologies, Tehran University of Medical Sciences, ‌Tehran, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده فناوری‌های نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hasheminia</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هاشمی نیا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006517</code>
	<orcid>570031947532846006517</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Nursing, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پرستاری، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Amin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tabatabaiefar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدامین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>طباطبایی فر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006518</code>
	<orcid>570031947532846006518</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Medicine, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Karimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کریمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846006519</code>
	<orcid>570031947532846006519</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>School of Medicine, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nafisi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نفیسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mrnafisi@yahoo.com</email>
	<code>570031947532846006520</code>
	<orcid>570031947532846006520</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>School of Medicine, Shahrekord University of Medical Sciences, Shahrekord, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
