Iranian South Medical Journal

fa کلونینگ ژن PapG اشریشیاکلی یوروپاتوژن و بررسی تنوع توالی آن PapG Gene cloning, Escherichia coli uropathogen and examination of its subsequence diversity عمومى General پژوهشي Original زمینه: اشریشیاکلی یوروپاتوژن، پاتوژن غالب در عفونت‌های ادراری می‌باشد. عفونت‌های دستگاه ادراری، یکی از شایع‌ترین عفونت&lrm;های انسانی می‌باشد. با وجود آنتی‌ژن‌ها و توکسین‌های مختلف باکتری‌های دخالت کننده در ایجاد عفونت، یکی از عوامل مهم در عفونت‌های ناشی از اشریشیاکلی و سایر باکتری‌های گرم منفی، چسبیدن باکتری به سطح سلول میزبان می‌باشد، بنابراین مهار اتصال باکتری، راهکاری مناسب جهت مهار عفونت می‌باشد. با توجه به‌اینکه، پروتئین PapG به‌عنوان ادهسین عمل می‌نماید، کاندیدی مناسب برای تهیه واکسن می‌باشد. <h3 dir="RTL" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt page-break-after: auto direction: rtl unicode-bidi: embed">مواد و روش‌ها: DNA ژنومیک باکتری اشریشیاکلی سویه بالینی حاوی ژن II papG، استخراج گردید. با طراحی پرایمر برای ژن papG II، واکنش PCR انجام گرفت. محصول PCR در پلاسمید (SK-)pBluescript کلون گردید. با استفاده از نرم‌افزار ClustalW و MEGA4 توالی به‌دست آمده با توالی ژنی موجود در بانک ژن هم‌طراز گردید و تنوع ژنی آن بررسی گردید.</h3> <h3 dir="RTL" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt page-break-after: auto direction: rtl unicode-bidi: embed">یافته‌ها بر اساس این همطرازی، ناحیه N ترمینال در سطح پروتئین و DNA حفاظت شده می‌باشد.</h3> <h3 dir="RTL" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt page-break-after: auto direction: rtl unicode-bidi: embed">نتیجه‌گیری: ناحیه N ترمینال ژن PapG در بین سویه‌های بالینی یک توالی حفاظت‌شده است و می‌توان از آن برای طراحی واکسن علیه عفونت ادراری استفاده نمود</h3> infections are one of the most prevalent human infections. Despite different antigens and toxins of interfering bacteria in infection, one of the important agents in the infections arising from Escherichia coli and the other gram negative bacteria is bacterial binding to host cell surface, so inhibiting the bacterial binding is an appropriate strategy to inhibit the infection. Whereas PapG protein acts as adhesion, it can be an appropriate candidate for developingvaccine. Material and Methods: A Genomic DNA of Escherichia coli bacterium extracted from clinical strain containing PapGII gene. Upon designing primer for PapGII gene, the PCR reaction was applied. The product of PCR was cloned in pBluescript (SK-) plasmid. Using Clustal W and MEGA4 software, the gained subsequence was alignmented with the gene subsequence existing in gene bank and its gene diversity was studied. Results: Based on was down alignment, N terminal on the protein surface and DNA are protected. Conclusion: N terminal domain of PapG gene is a conserved sequence among clinical straines? And it could be used for designing a vaccine against urinary tract infection. اشریشیاکلی یوروپاتوژن, پیلی‌تیپ P, ژن, کلونینگ Escherichia coli uropathogens, type P pili, gene, cloning 1 8 http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-307&slc_lang=fa&sid=1 Faezeh Hamidiyeh فائزه حمیدیه 570031947532846006380 570031947532846006380 No Department of Microbiology, School of Basic Sciences & Medicine, Islamic Azad University, Zanjan Branch, Zanjan, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پایه و پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی زنجان Mohammad Hassan Shirazi محمدحسن شیرازی shirzadeh@yahoo.com 570031947532846006381 570031947532846006381 Yes Department of Microbiology, School of Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Jalil Fallah Mehrabadi جلیل فلاح مهرآبادی 570031947532846006382 570031947532846006382 No Department of Genetic Engineering, Faculty of Biosciences and Biotechnology, Malekashtar University of Technology, Tehran, IRAN گروه مهندسی ژنتیک، پژوهشکده علوم فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر تهران Mohammadreza Pourmand محمدرضا پورمند 570031947532846006383 570031947532846006383 No Department of Microbiology, School of Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهرانگروه میکروب‌شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Samaneh Ostad Mohammadi سمانه استادمحمدی 570031947532846006384 570031947532846006384 No Department of Microbiology, School of Basic Sciences & Medicine, Islamic Azad University, Zanjan Branch, Zanjan, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پایه و پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی زنجان Hedrousha Molla agha Mirzaei هدروشا ملااقامیرزائی 570031947532846006385 570031947532846006385 No Department of Microbiology, School of Basic Sciences & Medicine, Islamic Azad University, Zanjan Branch, Zanjan, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده علوم پایه و پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی زنجان Davood Afshar داود افشار 570031947532846006386 570031947532846006386 No Department of Microbiology, School of Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران