fa ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع مایکوباکتریوم توبرکلوزیس عمومى General پژوهشي Original <p>زمینه: سرعت رشد سلولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس وابسته به رونویسی rRNA است که در مایکوباکتریوم توسط ژن carD کنترل می-شود. هدف این تحقیق، ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی متفاوت است. مواد و روش‌ها: ژنوم تخلیص شده 38 سویه بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت دارویی مختلف انتخاب شدند. پرایمرهای مورد نظر، با تعیین ژن‌های بالادست و پایین دست جهت تکثیر کامل ژن carD طراحی و با نرم‌افزارهای مربوطه ارزیابی شدند. با محاسبه دمای ذوب، دمای اتصال و برنامه PCR تنظیم شد. وجود ژن تکثیر شده با کمک الکتروفورز تأیید گردید. ژن، خالص‌سازی شده و مورد سکانس (توالی یابی) قرار گرفت. یافته‌ها: بررسی نتایج تعیین توالی نشان داد که ژن carD در نمونه‌های مختلف کلینیکی و سویه استاندارد، یکسان بوده و الگوی مشابه‌ای دارد. در این تحقیق مشخص گردید که دامین TRCF درمنطقه N ترمینال پروتئین carD در سویه‌های مورد مطالعه کاملاً حفاظت شده است. نتیجه‌گیری: این تحقیق، اولین مطالعه روی ژن card در سویه‌های بالینی می‌باشد. نتیجه سکانس، تعیین کننده وجود حفاظت در این ژن بود. با توجه به اهمیت این ژن در زندگی باکتری و عدم تغییر در توالی آن، در مطالعات آینده این ژن به‌عنوان هدفی مناسب برای تشخیص سریع و نیز طراحی یک مهار کننده ضد میکوباکتریوم پیشنهاد می‌گردد.</p> <p>Background: Mycobacterium tuberculosis growth rate is closely coupled to rRNA transcription which is regulated through CarD gene. The aim of this work was evaluation of conservation in CarD gene&rsquo;s sequence and its application in rapid detection of Mycobacterium tuberculosis. Materials and Methods: 38 clinical isolates of M. tuberculosis with different types of drug resistance were selected. PCR conditions and annealing temperature were selected by calculating thermal denaturation. Electrophoreses confirmed the presence of the amplified gene. Purified PCR product was sequenced by sequencer. Results: The size of amplified fragment of CarD gene was similar in all samples. By translation of nucleotide mode to amino acids it was found that TRCF domain in N-terminal of protein CarD was e fully conserved. Conclusion: This is the first study on the CarD gene in clinical isolates of MTB. This gene is recommended for use as a target for designing of suitable inhibitors as anti tuberculosis drug because of its importance in life of Mycobacterium Tuberculosis and being a conservative gene.</p> مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, ژن CarD, سکوئنس. Mycobacterium tuberculosis, CarD gene, sequence 263 271 http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-455&slc_lang=fa&sid=1 Mina Pirayandeh مینا پیراینده 570031947532846008917 570031947532846008917 No Department of Microbiology, Qom branch, Islamic Azad University, Qom, IRAN دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران Razieh Nazari راضیه نظری 570031947532846008918 570031947532846008918 No Department of Microbiology, Qom branch, Islamic Azad University, Qom, IRAN دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران Mohammad Reza Zolfaghari محمدرضا ذوالفقاری 570031947532846008919 570031947532846008919 No Department of Microbiology, Qom branch, Islamic Azad University, Qom, IRAN دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران Mohammad Arjmandzadegan محمد ارجمندزادگان arjomandzadegan@arakmu.ac.irn 570031947532846008920 570031947532846008920 Yes Tuberculosis and Pediatric Infectious Research Center and Department of Immunology and Microbiology, Faculty of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان و گروه ایمنی‌شناسی و میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Azam Ahmadi اعظم احمدی 570031947532846008921 570031947532846008921 No Tuberculosis and Pediatric Infectious Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Mana shojapoor مانا شجاع‌پور 570031947532846008922 570031947532846008922 No Molecular and Medicine Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک،ایران Fariba Rajabi فریبا رجبی 570031947532846008923 570031947532846008923 No Departments of Microbiology, Medicine School, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران