fa مقایسه روش‌های مولکولی در تیپ‌بندی اپیدمیولوژیک سویه‌های مقاوم به متی‌سیلین استافیلوکوکوس اورئوس عمومى General پژوهشي Original <p>زمینه: در این تحقیق روش‌های مولکولی موجود جهت تیپ‌بندی اپیدمیولوژیک استاف اورئوس مقاوم به متی‌سیلین مانند روش الکتروفورز در ژل با میدان الکتریکی ضربان‌دار (PFGE)، تیپ‌بندی بر مبنای توالی‌یابی لوکوس‌های چندگانه (MLST)، تیپ‌بندی بر مبنای توالی‌یابی ژنی پروتئین A (Spa) Staphylococcus aureus protein A typing، تیپ‌بندی به‌روش واحد تکراری مستقیم (dru)Direct repeat unit typing و بررسی تنوع در کاست کروموزومی (SCCmec)Staphylococcal Cassette Chromosome mec از نظر قدرت تمایز مقایسه شده‌اند. مواد و روش‌ها: از 389 ایزوله که قبلاً بررسی اپیدمیولوژیکی مولکولی بر روی آن‌ها انجام شده بود 61 نمونه غیرتکراری انتخاب و تحت تیپ‌بندی با الکتروفورز در ژل با میدان الکتریکی ضربان‌دار و تیپ‌بندی به‌روش واحد تکراری مستقیم قرار گرفتند. شاخص تمایز سیمپسون جهت تعیین قدرت تمایز هر روش و ضریب اتورگرسیون جهت تعیین قدرت تیپ‌بندی محاسبه گردید. یافته‌ها: 61 سوش مورد مطالعه به‌ترتیب با روش PFGE، MLST، spa، SCCmec و dru به 7، 6، 6، 12 و 19 تیپ تقسیم شدند. ارزیابی قدرت تمایز برای هر روش طبقه‌بندی با شاخص تنوع سیمپسون روش‌های dru و PFGEرا به‌عنوان بیشترین قدرت تمایز تعریف کرد. نتیجه‌گیری: با این مطالعه می‌توان این‌گونه نتیجه‌گیری کرد که اگرچه تیپ‌بندی با روشdru روشی با قدرت تمایز بالا، ارزان و آسان جهت بررسی اپیدمیولوژیک سویه‌های استاف اورئوس مقاوم به متی‌سیلین از تیپ 239ST می‌باشد ولی استفاده از ترکیب این روش‌ها مثل (dru و PFGE) می&lrm;تواند نتایج بهتری را جهت ارزیابی عفونت‌های بیمارستانی ارائه دهد.</p> <p>Background: The aim of present study was evaluation and comparison of widely used molecular techniques including pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multi locus sequence typing (MLST), Staphylococcus aureus protein A typing (spa), Staphylococcal Cassette Chromosome typing (SCCmec), and SCCmec typing with recently introduced method using direct repeat unit (dru) sequencing in the hyper-variable region of the SCCmec cassette for clustering and discrimination of MRSA isolates. Material and Methods: Out of 389 already molecularly established methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates 61 representative samples were subjected to PFGE and dru typing methods according to guideline. Results: The results showed that isolates were typed by PFGE typing, MLST typing, spa typing, SCCmec was typing and dru typing to 7,6,6,12,19 different types respectively. Evaluation of the discriminatory power for each method identified dru typing and PFGE as the most discriminatory methods. Conclusion: Although the discriminatory ability of dru typing, especially with closely related MRSA ST239 strains underscore its utility as a feasible and cheap method in epidemiological investigation of MRSA, we suggest the use of the conjugation of dru typing and PFGE typing for epidemiological surveillance studies, since this combination provides more discriminatory and typeability which is useful for the control of nosocomial infection.</p> استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت به متی‌سیلین, الکتروفورز در ژل با میدان الکتریکی ضربان‌دار, مقایسه روش‌های مختلف تیپ‌بندی ملکولی Methicillin resistance Staphylococcus aureus, PFGE, dru, molecular typing comparison 326 335 http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-462&slc_lang=fa&sid=1 Ehsanallah Ghaznavi-Rad احسان‌اله غزنوی‌راد ghaznaviehs@yahoo.com 570031947532846008959 570031947532846008959 Yes Department of Microbiology, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Alireza Amouzandeh nobaveh علی‌رضا آموزنده نوباوه 570031947532846008960 570031947532846008960 No Department of Microbiology, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران