<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian South Medical Journal</title>
<title_fa>مجله طب جنوب</title_fa>
<short_title>Iran South Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>57</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal57</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-4374</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-6954</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/ismj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2014</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه روش PCR با روش استاندارد MPN جهت تشخیص آلودگی باکتریایی در آب شرب</title_fa>
	<title>Comparison of PCR with Standard Method (MPN) for detection of bacterial contamination in drinking water</title>
	<subject_fa>عمومى</subject_fa>
	<subject>General</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p&gt;زمینه: تشخیص آلودگی میکروبی آب شرب به&#8204;روش کشت علاوه بر هزینه بری، زمان&#8204;بر بوده و بر حسب میزان آلودگی چند روز به&#8204;طول می&#8204;انجامد. این درحالی است که شهروندان در این زمان از آب مورد بررسی استفاده می&#8204;نمایند. روش&#8204;های ملکولی دارای حساسیت و سرعت عمل بالایی و زمان عملیاتی کمتری هستند. در این تحقیق روش Multiplex PCR جهت ارزیابی سریع میکروبی آب از نظر کلی فرم، Ecoli و تشخیص احتمالی باکتری&#8204;های VBNC در آزمایشگاه باکتریولوژی شرکت آب و فاضلاب استان مرکزی و مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان در فاز عملیاتی اجرا گردید. مواد و روش&#8204;ها: تشخیص سریع کلی فرم با کمک آمپلی فیکاسیون ژن&#8204;های lacZ و uidA در واکنش Multiplex PCR طراحی و اجرا گردید. 80 نمونه آب شرب شهر اراک شامل 41 نمونه چاه، 36 نمونه شبکه و 3 نمونه مخزن در این بررسی جمع&#8204;آوری شده و با استفاده از آمپلی&#8204;فیکاسیون ژن&#8204;های lacZ و uidA مورد آزمایش Multiplex PCR قرار گرفتند. همچنین آزمایش MPN به&#8204;عنوان روشی استاندارد و جهت مقایسه یافته&#8204;ها، روی تمامی نمونه&#8204;ها انجام شد. روش&#8204;های Multiplex PCR و MPNروی باکتری استاندارد، باکتری&#8204;های خالص شده از نمونه&#8204;های MPN مثبت و نیز CRM(Certificated Reference Material، (سویه مرجع) انجام گردیدند. یافته&#8204;ها: در نمونه&#8204;های چاه، شبکه و مخزن، اکثر نمونه&#8204;ها در هر دو روش نتایج مشابه را نشان دادند. نتیجه PCR روی باکتری استاندارد، کشت&#8204;های خالص شده نمونه&#8204;های MPN مثبت و CRM نیز تأیید کننده روش PCR بود. پنج نمونه دارای PCR مثبت و نتیجه MPN منفی گزارش شدند. زمان کل عملیات PCR با تغییر فاکتورها به حدود یکصد و پنج دقیقه کاهش یافت. نتیجه&#8204;گیری: روش Multiplex PCR، امکان شناسایی همزمان باکتری&#8204;های کلی فرم کل و اشرشیاکلی را در آب آشامیدنی فراهم نمود.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;Background: Detection of bacterial contamination in drinking water by culture method is a time and cost consuming method and spends a few days depending on contamination degree. However, the people use the tap water during that time. Molecular methods are rapid and sensitive. In this study a rapid Multiplex PCR method was used for rapid analysis both coliform bacteria and E.coli, and probable detection of VBNC bacteria in drinking water, the experiments were performed in bacteriological lab of water and Wastewater Corporation in Markazi province. Material and Methods:Amplification of a fragment from each of lacZ and uidA genes in a Multiplex PCR was used for detection of coliforms. Eight samples was taken from Arak drinking water system including 36 samples of wells, 41 samples of water distribution network and 3 samples from water storages were examined by amplification of lacZ and uidA genes in a Multiplex PCR. Equivalently, the MPN test was applied as a standard method for all samples for comparison of results. Standard bacteria, pure bacteria isolated from positive MPN and CRM were examined by PCR and MPN method. Results: The result of most samples water network, water storages, and water well were same in both MPN and PCR method .The results of standard bacteria and pure cultures of bacteria isolated from positive MPN and CRM confirmed the PCR method. Five samples were positive in PCR but negative in MPN method. Duration time of PCR was decreased about 105 min by changing the PCR program and electrophoreses factors. Conclusion: The Multiplex PCR can detect coliform bacteria and E.coli synchronous in drinking water.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>آب شرب, آلودگی باکتریایی, روشPCR , روش  MPN</keyword_fa>
	<keyword>Comparison, PCR method, Bacterial contamination, Drinking water, MPN method</keyword>
	<start_page>867</start_page>
	<end_page>878</end_page>
	<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-517&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Fatemeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dehghan </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دهقان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008720</code>
	<orcid>570031947532846008720</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department Of Microbiology, Qom Branch, Islamic Azad University, Qom, IRAN&lt;br&gt; Hygiene and Quality Control Office of Markazi Province, Water and Wastewater Company, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران&lt;br&gt; دفتر کنترل کیفیت و بهداشت شرکت آب و فاضلاب استان مرکزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zolfaghari </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ذوالفقاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008721</code>
	<orcid>570031947532846008721</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department Of Microbiology, Qom Branch, Islamic Azad University, Qom, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Arjomandzadegan </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ارجمندزادگان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>, mmatinam81@yahoo.com	arjomandzadegan@arakmu.ac.ir</email>
	<code>570031947532846008722</code>
	<orcid>570031947532846008722</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Tuberculosis and Pediatric Infectious Diseases Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Geravand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>گراوند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008723</code>
	<orcid>570031947532846008723</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Tuberculosis and Pediatric Infectious Diseases Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>GhplamReza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ahmari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>غلامرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>احمری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008724</code>
	<orcid>570031947532846008724</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Hygiene and Quality Control Office of Markazi Province, Water and Wastewater Company, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دفتر کنترل کیفیت و بهداشت شرکت آب و فاضلاب استان مرکزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Salomeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kalantari </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سالومه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کلانتری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008725</code>
	<orcid>570031947532846008725</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Hygiene and Quality Control Office of Markazi Province, Water and Wastewater Company, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>دفتر کنترل کیفیت و بهداشت شرکت آب و فاضلاب استان مرکزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kasravi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کسروی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008726</code>
	<orcid>570031947532846008726</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Arak, IRAN</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، ‏‏دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات،اراک،ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
