<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian South Medical Journal</title>
<title_fa>مجله طب جنوب</title_fa>
<short_title>Iran South Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>57</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal57</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-4374</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-6954</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/ismj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1394</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2015</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>18</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی مقایسه‌ای روش‌های مولکولی PCR-RFLP، آلل اسپسیفیک PCR و سکوئنس جهت تشخیص سریع مقاومت به ایزونیازید در سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</title_fa>
	<title>Comparison of PCR-RFLP and Allele Specific-PCR and sequencing in rapid diagnosis of isoniazid resistance in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis</title>
	<subject_fa>عمومى</subject_fa>
	<subject>General</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p&gt;زمینه: ایزونیازید یکی از داروهای خط اول درمان سل می&#8204;باشد که مقاومت به آن به&#8204;صورت فزاینده&#8204;ای گزارش می&#8204;شود. در مطالعه حاضر دو روش مولکولی جهت تشخیص سریع مقاومت سویه&#8204;های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به ایزونیازید طراحی و با نتایج سکوئنس مورد مقایسه قرار گرفتند. مواد و روش&#8204;ها: در این مطالعه 60 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، که با روش تعیین حساسیت دارویی (DST) مقاومت به ایزونیازید در آن&#8204;ها اثبات شده، استفاده گردید. سه روش مولکولیSequencing ،PCR-RFLP و Allele Specific-PCR جهت تعیین موتاسیون در کدون 315 مرتبط با مقاومت به ژن katG مقایسه شدند. بدین منظور با کمک پرایمرهای اختصاصی که قادر به تشخیص موتاسیون در این کدون بودند، روش آلل اسپسفیک اجرا گردید. علاوه بر این، در روش PCR-RFLP از آنزیم HpaII جهت برش آنزیمی محصولPCR استفاده شد، عدم برش توسط آنزیم به&#8204;عنوان رخداد موتاسیون در نظر گرفته شد. یافته&#8204;ها: بدین&#8204;منظور سویه&#8204;های حساس، مقاوم به دارو و سویه استاندارد H37Rv مورد استفاده قرار گرفتند. از سویه&#8204;های مورد مطالعه، تعداد 27 سویه مقاوم و 33 سویه حساس به ایزونیازید بودند. نتایج سکوئنس به&#8204;عنوان استاندارد طلایی مشخص نمود که AS-PCR و PCR-RFLP به&#8204;خوبی قادر به تشخیص موتاسیون در کدون 315 در سویه&#8204;های مقاوم فنوتیپی با حساسیت و ویژگی به&#8204;ترتیب 48/81 درصد و 100 درصد بودند. نتیجه&#8204;گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان می&#8204;دهد که روش&#8204;های PCR-RFLP و AS-PCR طراحی شده می&#8204;توانند به&#8204;عنوان روش&#8204;های ساده و سریع برای تعیین حساسیت و مقاومت به ایزونیازید در سویه&#8204;های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد استفاده قرارگیرند. پیشنهاد می&#8204;شود جهت کاهش ریسک خطا، با توجه به ساده و کم هزینه بودن به&#8204;صورت همزمان از هر دو تست برای تشخیص مقاومت به ایزونیازید استفاده شود.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;Background: Isoniazid is from the first-line drugs for treatment of tuberculosis. Resistance to Isoniazid is increasingly reported. In the study, molecular methods for rapid detection of isoniazid resistance in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis were compared. Materials and Methods : Sixty clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis were selected and their resistance and susceptibility were determined by proportional method. Molecular methods of PCR-RFLP and Allele Specific-PCR (AS-PCR) for determination of probably mutation in codon 315 of katG gene that related to Isoniazid resistance were used and compared by sequencing results as gold standard. In AS-PCR specific primers by proper PCR conditions were used. RFLP analysis of the PCR products was performed using the enzyme HpaII. Results: From 60 studied strains, 27 isolates were resistant and 33 strains were susceptible to isoniazid. Sequencing results showed that AS-PCR and PCR-RFLP well able to detect mutations in codon 315 of the strains by 81.48% sensitivity and 100% specificity respectively. None of the susceptible strains harbored mutation in katG315. Conclusion: Our results indicated that PCR-RFLP and AS - PCR methods were simple and fast methods for determination of isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis. These rapid and low cost methods is recommended simultaneously to reduce the risk of error in routine work.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>ایزونیازید, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, PCR-RFLP, Allele Specific-PCR</keyword_fa>
	<keyword>Isoniazid, Mycobacterium tuberculosis, PCR-RFLP, Allele Specific-PCR</keyword>
	<start_page>296</start_page>
	<end_page>303</end_page>
	<web_url>http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-586&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Hamid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bornasi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>برناسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008529</code>
	<orcid>570031947532846008529</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Immunology and Microbiology, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی و ایمنی‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Arjomandzadegan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ارجمندزادگان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>arjomandzadegan@arakmu.ac.ir</email>
	<code>570031947532846008530</code>
	<orcid>570031947532846008530</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Immunology and Microbiology, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran&lt;br&gt;Tuberculosis and Pediatric Infectious Diseases Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی و ایمنی‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک&lt;br&gt;مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ahmadreza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bahrmand </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بهرمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008531</code>
	<orcid>570031947532846008531</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Mycobacteriology Dept, Pasteur Institute of Iran, Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش سل و تحقیقات ریوی، انستیتو پاستور ایران، تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Alireza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hadizadeh Tasbiti </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هادی‌زاده تثبیتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008532</code>
	<orcid>570031947532846008532</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Mycobacteriology Dept, Pasteur Institute of Iran, Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش سل و تحقیقات ریوی، انستیتو پاستور ایران، تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Azam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ahmadi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اعظم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>احمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008533</code>
	<orcid>570031947532846008533</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Tuberculosis and Pediatric Infectious Diseases Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tayeboon </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>طیبون</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>570031947532846008534</code>
	<orcid>570031947532846008534</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Tuberculosis and Pediatric Infectious Diseases Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
