روش هیبریدیزاسیون در موضع توسط پروبهای نشان دار شده با مواد فلوئورسنت (FISH)، تکنیک نوینی است که علاوه برتشخیص اختصاصی میکروب ها در سطح مولکولی، مورفولوژی آنها را نیز به وضوح قابل رؤیت می سازد. در این مطالعه، به منظور ارزیابی روش FISH برای تشخیص استافیلوکوک ها، 76 نمونه خلط و 41 نمونه کشت خون مورد آزمایش قرار گرفت. در تکنیک مذکور، از سه پروب الیگونوکلئوتیدی که به 16S rRNA متصل می شوند استفاده شد. درمقایسه با روش کشت، حساسیت FISHبرای تشخیص استافیلوکوکوس اورئوس در نمونه های خلط7/86 %، و ویژگی آن 100% بود. در مورد نمونه های کشت خون، حساسیت و ویژگی FISH برای تشخیص استافیلوکوکوس اورئوس برابر با100%، و برای تشخیص استافیلوکوک های غیراورئوس حساسیت این روش 7/95% و ویژگی آن100%بود. کل مراحل FISH حداکثر به 3 ساعت زمان نیاز داشت. بنابراین FISH روشی سریع، حساس و اختصاصی برای تشخیص استافیلوکوک ها می‌باشد.