1- مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی ، mohadeseh.mozafari@yahoo.com 2- مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی 3- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم
چکیده: (11365 مشاهده)
زمینه: اخیراًٌ نشان داده شده است که سوشهای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ، رابطه مستقیمی با مقاومت دارویی دارند. بنابراین روشی ساده و سریع برای تشخیص و تمایز ایزولههای خانواده بیجینگ مورد نیاز میباشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی قدرت تمایز لوکوسهای مختلف دو روش 15 MIRU-VNTR و 12 MIRU-VNTR برای سویه-های بیجینگ و مقایسه آن با سایر سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس میباشد. مواد و روشها ابتدا 105 سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روشهای اسپولیگوتایپینگ شناسایی شدند، سپس با روشهای 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR مورد آنالیز ژنومی قرار گرفتند و تنوع آللی هر یک از لوکوسها با استفاده از آزمون HunterGaston Discriminatory Index (HGI) محاسبه شد. یافتهها: از 105 سویه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روش اسپولیگوتایپینگ، 20 سویه بیجینگ شناسایی شد (05/19 درصد). بررسی با روش 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR در کل سویهها نشان داد که 11 لوکوس جزء لوکوسهای بسیار افتراقدهنده بودند (6/0HGI≥) که از بین آنها لوکوس QUB26 بالاترین قدرت تمایز را داشت (84/0=HGI). تعداد تکرارها در لوکوسQUB11b برای سویههای بیجینگ اختصاصی بود. تنها لوکوس بسیار افتراقدهنده برای سویههای بیجینگ، MIRU16 بود. لوکوسهای QUB26، Mtub21،MIRU39 ، MIRU27، MIRU23 و MIRU26 جز لوکوسهای افتراق-دهنده متوسط (4/0≥HGI). نتیجهگیری: روش 12 و 15 لوکوس MIRU-VNTR ساده و سریع هستند و برای تمایز سویههای بیجینگ از سایر سویه-های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مناسب میباشند، اما برای تمایز بین سویههای مختلف بیجینگ مناسب نمیباشند و الگوهای بهدست آمده تقریباٌ مشابهند. قدرت افتراق روش 15 لوکوسی برای تمایز سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بالاتر از روش 12 لوکوسی بود.
Mozafari M, Farnia P, Jafarian M, Razavi Deligani M, Kazempour M, Masjedi M et al . Comparison of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype with other Mycobacterium tuberculosis strains Using MIRU-VNTR method. Iran South Med J. 2012; 15 (1) :1-12 URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-308-fa.html
مظفری محدثه، فرنیا پریسا، جعفریان مهدی، رضوی دلیگانی محمدرضا، کاظم پور مهدی، مسجدی محمدرضا و همکاران.. مقایسه مدل ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیجینگ با سایر سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش MIRU-VNTR. طب جنوب. 1391; 15 (1) :12-1
Iranian South Medical Journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License which allows users to read,
copy, distribute and make derivative works for non-commercial purposes from the material, as long as the author of the original work is cited properly