ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع مایکوباکتریوم توبرکلوزیس
|
مینا پیراینده1، راضیه نظری1، محمدرضا ذوالفقاری1، محمد ارجمندزادگان2، اعظم احمدی3، مانا شجاعپور4، فریبا رجبی5 |
1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران 2- مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان و گروه ایمنیشناسی و میکروبشناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران ، arjomandzadegan@arakmu.ac.irn 3- مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران 4- مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک،ایران 5- دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران |
|
چکیده: (5791 مشاهده) |
زمینه: سرعت رشد سلولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس وابسته به رونویسی rRNA است که در مایکوباکتریوم توسط ژن carD کنترل می-شود. هدف این تحقیق، ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع سویههای کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی متفاوت است. مواد و روشها: ژنوم تخلیص شده 38 سویه بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت دارویی مختلف انتخاب شدند. پرایمرهای مورد نظر، با تعیین ژنهای بالادست و پایین دست جهت تکثیر کامل ژن carD طراحی و با نرمافزارهای مربوطه ارزیابی شدند. با محاسبه دمای ذوب، دمای اتصال و برنامه PCR تنظیم شد. وجود ژن تکثیر شده با کمک الکتروفورز تأیید گردید. ژن، خالصسازی شده و مورد سکانس (توالی یابی) قرار گرفت. یافتهها: بررسی نتایج تعیین توالی نشان داد که ژن carD در نمونههای مختلف کلینیکی و سویه استاندارد، یکسان بوده و الگوی مشابهای دارد. در این تحقیق مشخص گردید که دامین TRCF درمنطقه N ترمینال پروتئین carD در سویههای مورد مطالعه کاملاً حفاظت شده است. نتیجهگیری: این تحقیق، اولین مطالعه روی ژن card در سویههای بالینی میباشد. نتیجه سکانس، تعیین کننده وجود حفاظت در این ژن بود. با توجه به اهمیت این ژن در زندگی باکتری و عدم تغییر در توالی آن، در مطالعات آینده این ژن بهعنوان هدفی مناسب برای تشخیص سریع و نیز طراحی یک مهار کننده ضد میکوباکتریوم پیشنهاد میگردد. |
|
واژههای کلیدی: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، ژن CarD، سکوئنس. |
|
متن کامل [PDF 761 kb]
(1330 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
عمومى دریافت: 1391/3/17 | پذیرش: 1391/5/25 | انتشار: 1393/3/24
|
|
|
|