Iranian South Medical Journal
مجله طب جنوب
Iran South Med J
Medical Sciences
http://ismj.bpums.ac.ir
57
journal57
1735-4374
1735-6954
10.52547/ismj
fa
jalali
1393
2
1
gregorian
2014
5
1
17
2
online
1
fulltext
fa
آنالیز دادههای متابونومیکس بهدست آمده از طیفسنجی تشدید مغناطیس هسته 1H NMR جهت ارائه مسیرهای متابولیکی بیماری آرتریت روماتوئید
H Nuclear magnetic resonance based metabonomics data analysis in rheumatoid arthritis
عمومى
General
پژوهشي
Original
<p>زمینه: آرتریت روماتوئید از بیماریهای اکتسابی بافت همبند میباشد و دارای زیر گروههای گوناگونی است که دربیشتر اوقات علت اصلی آن را نمیتوان مشخص نمود. هدف از این مطالعه، کاربرد اسپکتروسکوپی 1HNMR جهت بررسی نمای متابولیکی و کسب اطلاعات بیوشیمیایی خون انسان سالم و مقایسه متابولوم آنها با سرم خون بیمار آرتریت روماتوئیدی فعال میباشد. متابونومیکس بر پایه NMR، برای آنالیز سریع نمونههای بیولوژیکی مناسب بوده و روش اسپکتروسکوپی 1HNMR، نسبت بهروشهای دیگر آنالیز، ارجحیت دارد. آنالیز بیماری بهکمک تشدید مغناطیس هسته به تشخیص زود هنگام بیماری نیز منجر میگردد. بدیهی است، این تشخیص زود هنگام میتواند، تأثیر زیادی در کیفیت زندگی و روند بهبود این دسته از بیماران بنماید. در این مطالعه هدف ما بررسی پروفایل متابولیکی سرمی بیماران آرتریت روماتوئید بهمنظور شناسائی بیومارکر جدید و الگوی متابولیکی در این بیماران میباشد. مواد و روشها: به منظور بررسی متابولومیکس بیماران آرتریت روماتوئید از سرم خون 16 بیمار که در فاز فعال بیماری آرتریت روماتوئید بودند و 16 فرد سالم که از نظر جنس و سن مشابه گروه بیمار بودند استفاده شد. در تمام نمونهها، حضور فاکتور روماتوئیدی آرتریت از طریق افزایش در مقدار T1 مایع سینوویال مفصلی نشان داده شده است. در این مطالعه به کمک روشهای PCA و PLSDA و همچنین نرمافزارهای کنومکس و کد محاسباتی پرومتب در محیط متلب تمامی متابولیتهای موجود در این بیماری را طبقهبندی شد و یافتهها با بانک دادههای متابولیتی HNMR (www.metabolomics.ca) مقایسه شد. همچنین آزمونهای، ANA (Anti Nucleair Antibody) و Anti ccp (Anti cyclic citrullinated peptide) و اوره نیز بهکمک روش الایزا و رنگسنجی مورد ارزیابی قرار گرفت. یافتهها: در این بررسی، مسیرهای متابولیکی که بیشترین تغییرات را داشتهاند عبارتند از مسیر بیوسنتز هورمونهای استروئیدی، متابولیسم بیوتین، بیوسنتز اسیدهای چرب، مسیر بیوسنتز اسیدهای آمینه والین، لوسین و ایزولوسین و همچنین متابولیسم اسیدهای چرب لینولئیک شناسائی شدند. نتیجهگیری: در بیماری روماتیسم و بیماریهای مزمن التهابی، فعال شدن دستگاه دفاعی باعث مصرف بیش ازحد انرژی میگردد، ATP بهترین منبع انرژی درون سلولی است و از مسیرهای گلیکولیزوفسفوریلاسیون اکسیداتیو بهدست میآیند. تغییرات مشاهده شده در مسیر سنتز و ورود به سیکل کربس اسیدهای آمینه والین و لوسین و همچنین سنتز اسیدهای چرب آزاد نیز تأیید کننده نیاز بالای انرژی میباشد. در این افراد، افزایش سنتز و کاتابولیسم اسیدهای چرب منجر به تولید استیلکوا و سنتز اجسام کتونی میگردد. با توجه به اینکه بیماری روماتیسم زیر گروههای مختلفی داشته، و نیاز به روشهای دقیقتری جهت تشخیص میباشد، بنابراین پیشنهاد میگردد با استفاده از الگوی بهدست آمده از این مطالعه میتوان به پیدایش بیومارکرهای جدید در تشخیص زود هنگام بیماری روماتیسم کمک نمود.</p>
<p>Background: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic, systematic inflammatory disorder that may affect many tissues and organs, but principally attacks synovial joints and it is a common rheumatic disease with many subtypes. Nuclear Magnetic resonance (1H NMR) spectrometers with high sensitivity, resolution and dynamic range has permitted the rapid, simultaneous investigation of complex mixtures of endogenous or exogenous components present in biological materials. Metabonomics is the systematic study of chemical finger print resulted from cell reactions and could be used as a new biomarker for early disease diagnosis. In the present investigation, we studied serum metabolic profile in rheumatoid arthritis (RA) in order to find out the metabolic finger print pattern of the disease. Materials and methods: In our metabonomics study serum samples were collected from 16 patients with active RA, and from equal number of healthy subjects. They were evaluated during a one-year follow-up with the assessment of disease activity and 1H NMR spectroscopy of sera samples. In all the cases, the presence of active rheumatoid arthritis was shown by an increase in the T1 values of the synovium of the joints. We specified and classified all metabolites using PCA, PLSDA chemometrics methods. Chenomx (Trail Version) and ProMetab codes in Matlab software environments were used for our data analysis. Results were compared with the NMR metabolite data bank (www.metabolomics.ca). Anti-CCP, ANA and urea were also analyzed by ElISA and colorimetric methods respectively. Results: The most changes identified in this study were in the biosynthesis pathways of steroid hormones, biotin, fatty acids, amino acids (Leucine, Valin and isoleucine) and also linoleic acid. Conclusion: In rheumatoid arthritis disease, the activation of the immune system consumes larg amounts of energy. The main donor of free energy in cells is ATP, which is generated by both glycolysis and oxidative phosphorylation. Changes in amino acids and free fatty acids biosynthesis pathways confirm the high energy utilization. In this disease, the increase in free fatty acid metabolism leads to production of Acetyl CoA and ketone bodies. Since there are many diseases subtype in rheumatoid arthritis, more sensitive diagnostic method is required. The result of our investigation suggests that metabolome profiling method could be used as a new biomarker for early diagnosis of rheumatoid arthritis disease.</p>
: متابونومیکس, اسپکتروسکوپی NMR, PLSDA, PCA, Pattern recognition و آرتریت روماتوئید.
Metabonomics, rheumatoid arthritis, NMR spectroscopy, PCA, PLSDA, Pattern recognition, metabolic finger print
141
149
http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-437&slc_lang=fa&sid=1
Mohammad
Arjmand
محمد
ارجمند
570031947532846009061
570031947532846009061
No
Department of Biochemistry, Pasteur Institute of Iran, Tehran, IRAN
گروه بیوشیمی، انستیتو پاستور ایران
Atoosa
Golshahi
آتوسا
گلشاهی
570031947532846009062
570031947532846009062
No
Department of Biochemistry, Pasteur Institute of Iran, Tehran, IRAN
گروه بیوشیمی، انستیتو پاستور ایران
Ali
Movahed
علی
موحد
amovahed58@gmail,com.
570031947532846009063
570031947532846009063
Yes
Department of Biochemistry, School of Medicine, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, IRAN<br>Research Center for Nuclear Medicine, The Persian Gulf Biomedical Research Institute, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, IRAN
گروه بیوشیمی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر<br>مرکز تحقیقات پزشکی هستهای، پژوهشکده علوم زیست پزشکی خلیج فارس، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر
Azam
Amini
اعظم
امینی
570031947532846009064
570031947532846009064
No
Department of Rehumathology, School Of Medicine, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, IRAN
گروه روماتولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر
Ziba
Akbari
زیبا
اکبری
570031947532846009065
570031947532846009065
No
Department of Biochemistry, Pasteur Institute of Iran, Tehran, IRAN
گروه بیوشیمی، انستیتو پاستور ایران