دوره 20، شماره 5 - ( دو ماهنامه طب جنوب 1396 )
جلد 20 شماره 5 صفحات 436-426 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Moghadam A, Nazarian S. Molecular Typing Isolates of Salmonella Enterica Serovar Infantis Using Eric-PCR Method. Iran South Med J 2017; 20 (5) :426-436
URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-896-fa.html
URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-896-fa.html
مقدم ابوالفضل، نظریان شهرام. تایپینگ مولکولی جدایه‌های سالمونلا انتریکا سرووار اینفنتیس با استفاده از روش ERIC-PCR. مجله طب جنوب. 1396; 20 (5) :426-436
ابوالفضل مقدم1 
، شهرام نظریان* 2
، شهرام نظریان* 2
1- گروه سلولی و مولکولی، دانشکده زیست شناسی،دانشگاه تهران، تهران، ایران
2- گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین(ع)، تهران، ایران ،kpnazari@ihu.ac.ir
2- گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین(ع)، تهران، ایران ،
چکیده: (4558 مشاهده)
زمینه: سالمونلاها از باکتری‌های مهم خانواده انتروباکتریاسه بوده که از نظر بیوشیمیایی و سرولوژیک بسیار متنوع می‌باشند و عمدتاً از راه مواد غذایی منتقل می‌شوند. گسترش سالمونلاهای غیر تیفوئیدی یکی از مهم‌ترین موضوعات قابل بررسی در تحقیقات امروزی می‌باشد. بنابراین تشخیص و تایپینگ سریع این بیماری‌زاها اطلاعات مناسبی در ردیابی و کنترل عفونت در اختیار می‌دهد. هدف از مطالعه حاضر تایپینگ سویه‌های بالینی سالمونلا اینفنتیس می‌باشد.
مواد و روش‌ها: در این پژوهش از مراکز درمانی مختلف سویه‌های سالمونلا اینفنتیس جداسازی شد. تمامی سویه‌ها با استفاده از روش‌های استاندارد میکروبیولوژی، بیوشیمیایی و مولکولی مورد شناسایی قرار گرفتند. رابطه ژنتیکی سویه‌ها با استفاده از روش
ERIC-PCR مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: در این تحقیق از مجموع 842 نمونه مدفوع و خون بیماران مبتلا به اسهال، 48 سویه مربوط به سالمونلا اینفنتیس جداسازی شد. جدایه‌ها با استفاده از روش ERIC-PCR از نظر ژنوتایپینگ به 14 گروه مختلف دسته‌بندی شدند که بیشترین تعداد سویه در گروه 5ام (20 درصد،10 سویه) جای گرفتند.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که سویه‌های سالمونلا اینفنتیس مورد مطالعه از نظر ژنتیکی متنوع بودند که می‌تواند به علت شیوع پلی کلونال سویه‌ها در نمونه‌های انسانی باشد. همچنین نشان داده شد که روش ERIC-PCR قدرت تمایزی بالایی را جهت تایپینگ مولکولی دارد.
مواد و روش‌ها: در این پژوهش از مراکز درمانی مختلف سویه‌های سالمونلا اینفنتیس جداسازی شد. تمامی سویه‌ها با استفاده از روش‌های استاندارد میکروبیولوژی، بیوشیمیایی و مولکولی مورد شناسایی قرار گرفتند. رابطه ژنتیکی سویه‌ها با استفاده از روش
ERIC-PCR مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: در این تحقیق از مجموع 842 نمونه مدفوع و خون بیماران مبتلا به اسهال، 48 سویه مربوط به سالمونلا اینفنتیس جداسازی شد. جدایه‌ها با استفاده از روش ERIC-PCR از نظر ژنوتایپینگ به 14 گروه مختلف دسته‌بندی شدند که بیشترین تعداد سویه در گروه 5ام (20 درصد،10 سویه) جای گرفتند.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که سویه‌های سالمونلا اینفنتیس مورد مطالعه از نظر ژنتیکی متنوع بودند که می‌تواند به علت شیوع پلی کلونال سویه‌ها در نمونه‌های انسانی باشد. همچنین نشان داده شد که روش ERIC-PCR قدرت تمایزی بالایی را جهت تایپینگ مولکولی دارد.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
میکروب‌شناسی و ایمنولوژی
دریافت: 1395/11/13 | پذیرش: 1396/1/17 | انتشار: 1396/8/22
دریافت: 1395/11/13 | پذیرش: 1396/1/17 | انتشار: 1396/8/22
فهرست منابع
1. Lasser C, Miller S. Harrisons principles of internalmedicine. 17th ed. Fauci F, Braunwald E, Isselbacher K, editors. New York: McGraw-Hill, 2001, 970-5.
2. Skjolaas KA, Burkey TE, Dritz SS, et al. Effects of Salmonella enterica serovars Typhimurium (ST) and Choleraesuis (SC) on chemokine and cytokine expression in swine ileum and jejunal epithelial cells. Vet Immunol Immunopathol 2006; 111(3-4): 199-209 [DOI:10.1016/j.vetimm.2006.01.002]
3. Ranjbar R, Giammanco GM, Farshad Sh, et al. Serotypes, antibiotic resistance, and class 1 integrons in Salmonella isolates from pediatric cases of enteritis in Tehran, Iran. Foodborne Pathog Dis 2011; 8(4): 547-53. (Persian) [DOI:10.1089/fpd.2010.0736]
4. Wilson R, Feldman RA, Davis J, et al. Salmonellosis in infants: the importance of intrafamilial transmission. Pediatrics 1982; 69(4): 436-8.
5. Hulton CS, Higgins CF, Sharp PM. ERIC sequences: a novel family of repetitive elements in the genomes of Escherichia coli, Salmonella typhimurium and other enterobacteria. Mol Microbiol 1991; 5(4): 825-34. [DOI:10.1111/j.1365-2958.1991.tb00755.x]
6. Chmielewski R, Wieliczko A, Kuczkowski M, et al. Comparison of ITS profiling, REP- and ERIC-PCR of Salmonella Enteritidis isolates from Poland. J Vet Med B Infect Dis Vet Public Health 2002; 49(4): 163-8. [DOI:10.1046/j.1439-0450.2002.00544.x]
7. Burr MD, Josephson KL, Pepper IL. An evaluation of ERIC PCR and AP PCR fingerprinting for discriminating Salmonella serotypes. Lett Appl Microbiol 1998; 27(1): 24-30. [DOI:10.1046/j.1472-765X.1998.00378.x]
8. Weigel RM, Qiao B, Teferedegne B, et al. Comparison of pulsed field gel electrophoresis and repetitive sequence polymerase chain reaction as genotyping methods for detection of genetic diversity and inferring transmission of Salmonella. Vet Microbiol 2004; 100(3-4): 205-17. [DOI:10.1016/j.vetmic.2004.02.009]
9. Muńoz P, Díaz MD, Rodríguez-Créixems M, et al. Antimicrobial resistance of Salmonella isolates in a Spanish hospital. Antimicrob Agents Chemother 1993; 37(5): 1200-2. [DOI:10.1128/AAC.37.5.1200]
10. Llanes C, Kirchgesner V, Plesiat P. Propagation of TEM- and PSE-type beta-lactamases among amoxicillin-resistant Salmonella spp. isolated in France. Antimicrob Agents Chemother 1999; 43(10): 2430-6. [DOI:10.1128/AAC.43.10.2430]
11. Wray C, McLaren I, Parkinson NM, et al. Differentiation of Salmonella typhimurium DT204c by plasmid profile and biotyping. Vet Rec 1987; 121(22): 514-6. [DOI:10.1136/vr.121.22.514]
12. Eshraghi S, Soltan Dalall M, Fardsanei F, et al. Salmonella enteritidis and antibiotic resistance patterns: A study on 1950 children with diarrhea. Tehran Univ Med J 2010; 67(12): 876-82. (Persian)
13. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV. How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemiological studies of bacterial infections: a review for healthcare epidemiologists. Molecular Typing Working Group of the Society for Healthcare Epidemiology of America. Infect Control Hosp Epidemiol 1997; 18(6): 426-39 [DOI:10.2307/30141252]
14. Ross IL, Heuzenroeder MW. A comparison of three molecular typing methods for the discrimination of Salmonella enterica serovar Infantis. FEMS Immunol Med Microbiol 2008; 53(3): 375-84. [DOI:10.1111/j.1574-695X.2008.00435.x]
15. Stevens A, Kerouanton A, Marault M, et al. Epidemiological analysis of Salmonella enterica from beef sampled in the slaughterhouse and retailers in Dakar (Senegal) using pulsed-field gel electrophoresis and antibiotic susceptibility testing. Int J Food Microbiol 2008; 123(3): 191-7. [DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2008.01.007]
16. Nógrády N, Kardos G, Bistyák A, et al. Prevalence and characterization of Salmonella infantis isolates originating from different points of the broiler chicken-human food chain in Hungary. Int J Food Microbiol 2008; 127 (1-2): 162-7. [DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2008.07.005]
17. Merino LA, Ronconi MC, Navia MM, et al. Analysis of the clonal relationship among clinical isolates of Salmonella enterica serovar Infantis by different typing methods. Rev Inst Med Trop Sao Paulo 2003; 45(3): 119-23. [DOI:10.1590/S0036-46652003000300001]
18. Nath G, Maurya P, Gulati AK. ERIC PCR and RAPD based fingerprinting of Salmonella Typhi strains isolated over a period of two decades. Infect Genet Evol 2010; 10(4): 530-6. [DOI:10.1016/j.meegid.2010.02.004]
19. Ranjbar R, Torabi R, Mirzaie A. Molecular typing of Salmonella enteritidis strains isolated in several laboratory centers in Tehran by ERIC-PCR. Sci J Kurdistan Univ Med Sci (SJKU) 2013; 18(2): 77-85. (Persian)
20. Soria G, Barbé J, Gibert I. Molecular fingerprinting of Salmonella typhimurium by IS200-typing as a tool for epidemiological and evolutionary studies. Microbiologia 1994; 10(1-2): 57-68.
21. Saxena MK, Singh VP, Lakhcharua BD, et al. Strain differentiation of Indian isolates of Salmonella by ERIC-PCR. Res Vet Sci 2002; 73(3): 313-4. [DOI:10.1016/S0034-5288(02)00030-9]
22. Madalena V, Mario G, Rogerio T, et al. Evaluation of PCR-based fingerprinting comparatively to the RFLP-PFGE for discrimination of Salmonella sp. isolated from slaughtered pork polymerase chain reaction identification of Salmonella serotypes. J Food Drug Anal 2008; 16(1): 88-95.
23. Fardsanei F, Nikkhahi F, Bakhshi B ,et al. Molecular characterization of Salmonella enterica serotype Enteritidis isolates from food and human samples by serotyping, antimicrobial resistance, plasmid profiling, (GTG)5-PCR and ERIC-PCR. New Microbes New Infect. 2016 ; 14:24-30 [DOI:10.1016/j.nmni.2016.07.016]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
