دوره 21، شماره 2 - ( دوماهنامه طب جنوب 1397 )                   جلد 21 شماره 2 صفحات 161-147 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Darvishi M, Moradinasab M, Hosseini S J, Mohammadnia R, Aminikhoei Z, Nasri S et al . Molecular Identification of Shallow Water Zoanthids in the Coast of Bushehr- Persian Gulf. Iran South Med J 2018; 21 (2) :147-161
URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-923-fa.html
درویشی ماشااله، مرادی‌نسب مریم، حسینی سیدجواد، محمدنیا رضا، امینی‌خوئی زهرا، نصری سیما و همکاران.. شناسایی ملکولی زوانتید‌های آب‌های کم ژرفا در سواحل بوشهر- خلیج‌فارس. مجله طب جنوب. 1397; 21 (2) :147-161

URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-923-fa.html


1- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نور تهران، تهران، ایران
2- مرکز تحقیقات طب گرمسیری و عفونی خلیج‌فارس، پژوهشکده‌ علوم زیست پزشکی خلیج‌فارس، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران ، m.moradinasab85@gmail.com
3- گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده خلیج‌فارس، دانشگاه خلیج‌فارس، بوشهر، بوشهر، ایران
4- اداره کل دامپزشکی استان بوشهر، بوشهر، ایران
5- مرکز تحقیقات آبهای دور چابهار، مؤسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، چابهار، ایران
6- مرکز تحقیقات زیست فناوری دریایی خلیج‌فارس، پژوهشکده علوم زیست پزشکی خلیج‌فارس، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
چکیده:   (4621 مشاهده)
زمینه: راسته‌ی زوآنتاریا (Cnidaria: Anthozoa) یکی از راسته‌های کمتر بررسی شده در خلیج‌فارس است. این گروه از سنیداریا‌ها غالباً در آب‌های گرم مناطق متفاوت جهان یافت می‌شوند و شناسایی مورفولوژیک آنها به دلیل تنوع رنگی گسترده، در سطح گونه بسیار پیچیده است. بدین منظور در این مطالعه برای نخستین بار تنوع زوانتید‌های آب‌های کم ژرفا خلیج‌فارس– سواحل بوشهر به روش فیلوژنتیک ملکولی مورد بررسی قرار گرفت. 
مواد و روش‌ها: بیست و چهار کلونی زوانتید با شکل و رنگ‌های متفاوت از نواحی جزر و مدی و کم عمق سواحل بوشهر جمع‌آوری شدند. پس از استخراج DNA به روش CTAB- فنل- کلروفروم، قطعه ژنی مارکر‌های میتوکندریایی COI و 16S rDNA و مارکر هسته‌ای ITS-rDNA با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) تکثیر و توالی‌یابی شد.
یافته‌ها: براساس توالی‌های بدست آمده، وجود چهار گونه Zoanthus sociatus، Zoanthus pulchellus،Zoanthus sansibaricus و mutuki Palythoa aff در ساحل بوشهر اثبات شد. گونه Palythoa aff. mutuki مشاهده شده در این مطالعه دارای توالی یکسان با گونه‌ پیشتر گزارش شده در خلیج‌فارس می‌باشد. با این وجود در این مطالعه دو گونه جدید توصیف نشده از جنس Zoanthus (Z.sociatus و Z.pulchellus) شناسایی شدند.
نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه حاضر حاکی از کارایی کاربرد مارکرهای ملکولی در مقایسه با ویژگی‌های موروفولوژیک جهت شناسایی راسته زوآنتاریا به‌ویژه در سطح گونه می‌باشد. بی‌شک مطالعات هر چه بیشتر به منظور تعیین الگوی پراکنش ‌زوانتیدها‌ دانش‌ ما ‌را ‌در ‌رابطه ‌با ‌تنوع‌ زیستی‌ خلیج‌‌فارس ‌افزایش ‌خواهد ‌داد.
واژه‌های کلیدی: زوآنتاریا، COI، mt 16S rDNA، ITS-rDNA، خلیج‌فارس
متن کامل [PDF 761 kb]   (986 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: 1396/9/6 | پذیرش: 1396/11/23 | انتشار: 1397/3/30

فهرست منابع
1. Burnett W, Benzie J, Beardmore J, et al. Zoanthids (Anthozoa, Hexacorallia) from the Great Barrier Reef and Torres Strait, Australia: systematics, evolution and a key to species. Coral Reefs 1997; 16(1): 55-68. [DOI:10.1007/s003380050060]
2. Reimer JD, Irei Y, Fujii T. Two new species of Neozoanthus (Cnidaria, Hexacorallia, Zoantharia) from the Pacific. ZooKeys 2012; (246): 69-87. [DOI:10.3897/zookeys.246.3886]
3. Miyashita M, Sasaki M, Hattori I, et al. Total synthesis of norzoanthamine. Science 2004; 305(5683): 495-9. [DOI:10.1126/science.1098851]
4. Fujii T, Reimer JD. Phylogeny of the highly divergent zoanthid family Microzoanthidae (Anthozoa, Hexacorallia) from the Pacific. Zool Scr 2011; 40(4): 418-31. [DOI:10.1111/j.1463-6409.2011.00479.x]
5. Behenna DC, Stockdill JL, Stoltz BM. The biology and chemistry of the zoanthamine alkaloids. Angew Chem Int Ed Engl 2008; 47(13): 2365-86. [DOI:10.1002/anie.200703172]
6. Reimer JD, Ono S, Iwama A, et al. Morphological and molecular revision of Zoanthus (Anthozoa: Hexacorallia) from southwestern Japan, with descriptions of two new species. Zoolog Sci 2006; 23(3): 261-75. [DOI:10.2108/zsj.23.261]
7. Shearer T, Van Oppen M, Romano S, et al. Slow mitochondrial DNA sequence evolution in the Anthozoa (Cnidaria). Mol Ecol 2002; 11(12): 2475-87. [DOI:10.1046/j.1365-294X.2002.01652.x]
8. Reimer JD, Todd PA. Preliminary molecular examination of zooxanthellate zoanthid (Hexacorallia, Zoantharia) and associated zooxanthellae (Symbiodinium spp.) diversity in Singapore. Raffles Bull Zool 2009; 22: 103-20. [Link]
9. Reimer JD, Ono S, Fujiwara Y, et al. Reconsidering Zoanthus spp. diversity: molecular evidence of conspecifity within four previously presumed species. Zoolog Sci 2004; 21(5): 517-25. [DOI:10.2108/zsj.21.517]
10. Reimer J, Sinniger F, Hickman Jr C. Zoanthid diversity (Anthozoa: Hexacorallia) in the Galapagos Islands: a molecular examination . Coral Reefs 2008; 27(3): 641-54. [DOI:10.1007/s00338-008-0376-5]
11. Reimer JD, Hirose M, Wirtz P. Zoanthids of the Cape Verde Islands and their symbionts: previously unexamined diversity in the Northeastern Atlantic. Contrib zool 2010; 79(4): 147-63. [DOI:10.1163/18759866-07904002]
12. Reimer JD, Hirose M ,Yanagi K, et al. Marine invertebrate diversity in the oceanic Ogasawara Islands: a molecular examination of zoanthids (Anthozoa: Hexacorallia) and their Symbiodinium (Dinophyceae). Syst Biodivers 2011; 9(2): 133-43. [DOI:10.1080/14772000.2011.569034]
13. Reimer JD, Irei Y, Fujii T, et al. Molecular analyses of shallow-water zooxanthellate zoanthids (Cnidaria: Hexacorallia) from Taiwan and their Symbiodinium spp. Zool Stud 2013; 52(1):38. [DOI:10.1186/1810-522X-52-38]
14. Koupaei AN, Mostafavi PG, Mehrabadi JF, et al. Molecular diversity of coral reef-associated zoanthids off Qeshm Island, northern Persian Gulf. International Aquatic Research 2014; 6(2): 1-10. [DOI:10.1007/s40071-014-0064-8]
15. Koupaei AN, Mostafavi PG, Mehrabadi JF, et al. Diversity of shallow water zoantharians in Hengam and Larak Islands, in the Persian Gulf. J Mar Biol Assoc U.K. 2015: 1-11. [Article]
16. Baker AC. The symbiosis ecology of reef-building corals [dissertation]. United States: University of Miami, 1999. [Article]
17. Vrijenhoek R. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol 1994; 3(5): 294-9. [Link]
18. Sinniger F, Montoya-Burgos J-I, Chevaldonné P, et al. Phylogeny of the order Zoantharia (Anthozoa, Hexacorallia) based on the mitochondrial ribosomal genes. Mar Biol 2005; 147(5): 1121-8. [DOI:10.1007/s00227-005-0016-3]
19. Reimer JD, Takishita K, Ono S, et al. Molecular evidence suggesting interspecific hybridization in Zoanthus spp.(Anthozoa: Hexacorallia). Zoolog Sci 2007; 24(4): 346-59. [DOI:10.2108/zsj.24.346]
20. Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Res 1994; 22(22): 4673-80. [DOI:10.1093/nar/22.22.4673]
21. MrModeltest2., C program for selecting DNA substitution models using PAUP*. (Accessed May 5, 2018, at https://github.com/nylander/MrModeltest2/). [Article]
22. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol 1980; 16(2): 111-20. [DOI:10.1007/BF01731581]
23. Tamura K. Estimation of the number of nucleotide substitutions when there are strong transition-transversion and G+ C-content biases. Mol Biol Evol 1992; 9(4): 678-87. [Article]
24. Tamura K, Stecher G, Peterson D, et al. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 2013; 30(12): 2725-9. [DOI:10.1093/molbev/mst197]
25. Swain TD. Isozoanthus antumbrosus, a new species of zoanthid (Cnidaria: Anthozoa: Zoanthidea) symbiotic with Hydrozoa from the Caribbean, with a key to hydroid and spongesymbiotic zoanthid species. Zootaxa 2009; 2051: 41-8. [DOI:10.11646/zootaxa.2051.1.3]
26. Ong CW, Reimer JD, Todd PA. Morphologically plastic responses to shading in the zoanthids Zoanthus sansibaricus and Palythoa tuberculosa. J Mar Biol 2013; 160(5): 1053-64. [DOI:10.1007/s00227-012-2158-4]
27. Reimer JD, Foord C, Irei Y. Species diversity of shallow water zoanthids (Cnidaria: Anthozoa: Hexacorallia) in Florida. J Mar Biol 2012; 2012. [DOI:10.1155/2012/856079]
28. Huang D, Meier R, Todd PA, et al. Slow mitochondrial COI sequence evolution at the base of the metazoan tree and its implications for DNA barcoding. J Mol Evol 2008; 66(2): 167-74. [DOI:10.1007/s00239-008-9069-5]
29. Sinniger F, Reimer JD ,Pawlowski J. Potential of DNA sequences to identify zoanthids (Cnidaria: Zoantharia). Zoolog Sci 2008; 25(12): 1253-60. [DOI:10.2108/zsj.25.1253]
30. Reimer J, Takishita K, Ono S, et al. Diversity and evolution in the zoanthid genus Palythoa (Cnidaria: Hexacorallia) based on nuclear ITS-rDNA. Coral Reefs 2007; 26(2): 399-410. [DOI:10.1007/s00338-007-0210-5]
31. Swain TD. Phylogeny-based species delimitations and the evolution of host associations in symbiotic Zoanthusids (Anthozoa, Zoanthusidea) of the wider Caribbean region. Zool J Linn Soc 2009; 156(2): 223-38. [DOI:10.1111/j.1096-3642.2008.00513.x]
32. Mehra R, Yadav DS, Kundu P, et al. First report of Zoanthus pulchellus from India. J Mar Biotechnol 2015 ;1(1):1-4. [Link]
33. Reimer JD, Ishikawa SA, Hirose M. New records and molecular characterization of Acrozoanthus (Cnidaria: Anthozoa: Hexacorallia) and its endosymbionts (Symbiodinium spp.) from Taiwan. Marine Biodiversity 2011; 41(2): 313-23. [DOI:10.1007/s12526-010-0069-5]
34. Ryland JS, Lancaster JE. Revision of methods for separating species of Protopalythoa (Hexacorallia: Zoanthidea) in the tropical West Pacific. Invertebr syst 2003; 17(3): 407-28. [DOI:10.1071/IS02008]
35. Sinniger F. Zoantharia of New Caledonia. Compendium of marine species from New Caledonia Documents scientifiques et techniques II 2006; 7: 127-8. [Link]
36. Santos MEA, Kitahara MV, Lindner A, et al. Overview of the order Zoantharia (Cnidaria: Anthozoa) in Brazil. Marine Biodiversity 2016; 46(3): 547-59. [DOI:10.1007/s12526-015-0396-7]

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله طب جنوب می‌باشد.

طراحی و برنامه نویسی: یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Iranian South Medical Journal

Designed & Developed by: Yektaweb