دوره 23، شماره 3 - ( دو ماهنامه طب جنوب 1399 )
جلد 23 شماره 3 صفحات 204-195 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ghaderi M, Khamisipour G, Obeidi N, Tahmasebi R, Mohammadi S A, Rastgoo R et al . Pathway Analysis of miRNA-1 and Its Expres-sion Evaluation in Donor’s Serum from HIV-Positive Individuals vs Unaffected Controls. Iran South Med J 2020; 23 (3) :195-204
URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-1303-fa.html
URL: http://ismj.bpums.ac.ir/article-1-1303-fa.html
قادری میلاد، خمیسی‌پور غلامرضا، عبیدی نرگس، طهماسبی رحیم، محمدی سیدامین، راستگو راضیه و همکاران.. مسیرهای مربوط به microRNA-1 و مقایسه بیان آن در سرم اهداکنندگان خون با نتیجه مثبت آزمایش HIV نسبت به افراد سالم. مجله طب جنوب. 1399; 23 (3) :195-204
میلاد قادری1 
، غلامرضا خمیسی‌پور* 2، نرگس عبیدی1 ، رحیم طهماسبی3 ، سیدامین محمدی1 ، راضیه راستگو1 ، مولود بهبهانی‌پور4
، غلامرضا خمیسی‌پور* 2، نرگس عبیدی1 ، رحیم طهماسبی3 ، سیدامین محمدی1 ، راضیه راستگو1 ، مولود بهبهانی‌پور4
1- گروه هماتولوژی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
2- گروه هماتولوژی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران ،ghr.khamisi@gmail.com
3- گروه آمار زیستی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
4- گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
2- گروه هماتولوژی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران ،
3- گروه آمار زیستی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
4- گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
چکیده: (3210 مشاهده)
زمینه: ریز RNAها (miRNA)، مولکول‌های RNA غیرکننده (24-19 نوکلئوتیدی) هستند که در طیف وسیعی از فرایندهای زیستی از طریق تنظیم پس از رونویسی بیان ژن، نقش مهمی ایفا می‌کنند. تغییر بیان miRNAها در بیماری‌های عفونی مختلف نظیر عفونت HIV گزارش شده است. تعیین پروفایل‌های بیانی miRNA خصوصاً در مایعات زیستی پستانداران که متأثر از فرایندهای داخل سلولی نقاط مختلف بدن می‌باشد دید جامعی در ارتباط با تغییرات پاتوفیزیولوژی مرتبط با برهمکنش‌های ویروس- میزبان در اختیار می‌گذارد. از این رو هدف از مطالعه حاضر بر پایه تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی miR-1 در ارتباط با مسیرهای پیام‌رسان متأثر بالقوه در عفونت HIV، تعیین پروفایل بیانی miR-1 در سرم اهداکنندگان خون با نتیجه آزمایش HIV مثبت نسبت به افراد سالم در مرکز انتقال خون بوشهر می‌باشد.
مواد و روش‌ها: تجزیه و تحلیل غنی‌سازی روی ژن‌های هدف پیش‌بینی شده برای miR-1 بر پایه ابزارهای بیوانفورماتیکی مرتبط به miRNAها برای دستیابی به مسیرهای احتمالی تحت تنظیم این miRNA صورت گرفت، با توجه به مسیرهای متأثر در عفونت HIV و درگیری ژن‌های هدف miR-1 در این مسیرهای سیگنالینگ، ارزیابی بیان miR-1 در نمونه‌های سرم خون 20 فرد HIV مثبت تحت درمان، 10 فرد HIV مثبت تازه تشخیص داده شده و 40 فرد سالم بوسیله qRT-PCR انجام پذیرفت. داده‌ها با نرم‌افزار آماری SPSS ویرایش 22 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.
مواد و روش‌ها: تجزیه و تحلیل غنی‌سازی روی ژن‌های هدف پیش‌بینی شده برای miR-1 بر پایه ابزارهای بیوانفورماتیکی مرتبط به miRNAها برای دستیابی به مسیرهای احتمالی تحت تنظیم این miRNA صورت گرفت، با توجه به مسیرهای متأثر در عفونت HIV و درگیری ژن‌های هدف miR-1 در این مسیرهای سیگنالینگ، ارزیابی بیان miR-1 در نمونه‌های سرم خون 20 فرد HIV مثبت تحت درمان، 10 فرد HIV مثبت تازه تشخیص داده شده و 40 فرد سالم بوسیله qRT-PCR انجام پذیرفت. داده‌ها با نرم‌افزار آماری SPSS ویرایش 22 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.
یافته‌ها: تجزیه و تحلیل غنی‌سازی شده برای ژن‌های هدف miR-1 نشان می‌دهد که ژن‌های هدف به میزان قابل توجه (05/0>FDR) در 4 مسیر پیام‌رسان هورمون تیروئید، مسیرهای سرطان، اندوسیتوز، سیستم پیام‌رسان فسفاتیدیل اینوزیتول متمرکز شدند، علاوه بر این، افزایش بیان قابل توجه miR-1 (05/0>P) در افراد مبتلا به HIV تازه تشخیص داده شده نسبت به افراد سالم، همچنین کاهش بیان قابل توجه
miR-1 (001/0>P) در افراد HIV مثبت تحت درمان نسبت به افراد مبتلا به HIV تازه تشخیص داده شده مشاهده گردید.
نتیجه‌گیری: مطالعات بیوانفورماتیک حاکی از آن است که ژن‌های هدف پیش‌بینی شده برای miR-1 متعلق به مسیرهای مرتبط با هورمون تیروئید، سرطان، اندوسیتوز و سیستم پیام‌رسان فسفاتیدیل اینوزیتول می‌باشند؛ که از جمله مسیرهای مختل شده در عفونت HIV می‌باشند. علاوه بر این، تغییر بیان قابل توجه miR-1 در سرم خونی بیماران مبتلا به HIV تازه تشخیص داده شده نسبت به افراد سالم و افراد HIV مثبت تحت درمان نسبت به بیماران مبتلا به HIV تازه تشخیص داده شده تأثیرات قابل توجه فرایندهای بیماری‌زایی ویروس HIV بر بیان miR-1 را نشان می‌دهد. از این رو، یافته‌های این مطالعه نشان دهنده پتانسیل استفاده از miR-1 در راستای درک بهتر بیماری‌زایی ویروس HIV و مداخلات درمانی متعاقب بواسطه هدف قرار دادن آن miRNA می‌باشد.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
دستگاه خون و لنف
دریافت: 1397/4/9 | پذیرش: 1398/11/16 | انتشار: 1399/5/6
دریافت: 1397/4/9 | پذیرش: 1398/11/16 | انتشار: 1399/5/6
فهرست منابع
1. Grez M, Dietrich U, Balfe P, et al. Genetic Analysis Of Human Immunodeficiency Virus Type 1 And 2 (HIV-1 And HIV-2) Mixed Infections In India Reveals A Recent Spread Of HIV-1 And HIV-2 From A Single Ancestor For Each Of These Viruses. J Virol 1994; 68(4): 2161-8. [DOI:10.1128/JVI.68.4.2161-2168.1994]
2. Nam JG, Kim GJ, Baek JY, et al. Molecular Investigation Of Human Immunodeficiency Virus Type 2 Subtype A Cases In South Korea. J Clin Microbiol 2006; 44(4): 1543-6. [DOI:10.1128/JCM.44.4.1543-1546.2006]
3. Kanki PJ, Travers KU, Marlink R, et al. Slower Heterosexual Spread Of HIV-2 Than HIV-1. Lancet 1994; 343(8903): 943-6. [DOI:10.1016/S0140-6736(94)90065-5]
4. Verma P, Pandey RK, Prajapati P, et al. Circulating Micrornas: Potential And Emerging Biomarkers For Diagnosis Of Human Infectious Diseases. Front Microbiol 2016; 7: 1274. [DOI:10.3389/fmicb.2016.01274]
5. Balasubramaniam M, Pandhare J, Dash C. Are Micrornas Important Players In HIV-1 Infection? An Update. Viruses 2018; 10(3): e110. [DOI:10.3390/v10030110]
6. Ahmadi K, Soleimani M, Kaviani S, et al. Effect Of Overexpression Of Mir-29b1 On Induction Of Apoptosis In Leukemic HL60 Cell Line. Iran South Med J 2014; 17(3): 243-53. (Persian)
7. Munshi SU, Panda H, Holla P, et al. Microrna150 Is A Potential Biomarker Of HIV/AIDS Disease Progression And Therapy. Plos One 2014; 9(5): E95920. [DOI:10.1371/journal.pone.0095920]
8. Zhou Y, Sun L, Wang X, et al. Short Communication: HIV-1 Infection Suppresses Circulating Viral Restriction Micrornas. AIDS Res Hum Retroviruses 2016; 32(4): 386-9. [DOI:10.1089/aid.2015.0253]
9. Kraj B. Incorporation Of Molecular Diagnostics Into Medical Laboratory Science Curriculum: Clinical Facilities Expectations. An Asynchronous, Iterative, Online Delphi Study [dissertation]. Virginia: Virginia Commonwealth Univ., 2015.
10. Akhtar MM, Micolucci L, Islam MS, et al. Bioinformatic Tools For Microrna Dissection. Nucleic Acids Res 2016; 44(1): 24-44. [DOI:10.1093/nar/gkv1221]
11. François F, Klotman ME. Phosphatidylinositol 3-Kinase Regulates Human Immunodeficiency Virus Type 1 Replication Following Viral Entry In Primary CD4+ T Lymphocytes And Macrophages. J Virol 2003; 77(4): 2539-49. [DOI:10.1128/JVI.77.4.2539-2549.2003]
12. Marsh M, Pelchen‐Matthews A. Endocytosis In Viral Replication. Traffic 2000; 1(7): 525-32. [DOI:10.1034/j.1600-0854.2000.010701.x]
13. Elfaki MG. Immunosuppression Induced By HIV Infection. Biol Med 2014; 6(3): 1. [DOI:10.4172/0974-8369.1000e111]
14. Noureldeen AF, Qusti SY, Khoja GM. Thyroid Function In Newly Diagnosed HIVInfected Patients. Toxicol Ind Health 2014; 30(10): 919-25. [DOI:10.1177/0748233712466133]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
